クラミジア陽性反応が1ヶ月ほど前、診断され投薬。

服用後4週間後検査結果が陰性だった場合翌日から性行為を行っても問題ないでしょうか。

はい、しっかり期間を空けて再検査をしていますので、そこで陰性であれば性行為を開始して構いません。