男です。2週間前に行為（ゴムあり、オーラルなし）をしました。気になったので行為から３日後に即日検査をして淋菌クラミジアが陰性でした。それでも喉、尿道に軽い痛みを感じる気がしてしまい不安です。再度検査するべきでしょうか？

性病以外の可能性も考えるべきだと思います。皆さん直近に性行為があったので、真っ先に性病を疑いますが、意外と陰性の場合も多いです。そのため他の原因も探っていくのが良いと思います。