現在PEPを服用しています。薬は毎日決まった時間に服用していますが、行為があってからほぼ3週間後に喉の痛み、熱っぽさ、関節痛、倦怠感が4日ほど続いています。

HIVの初期症状と合致しますが、感染した可能性があるということなんでしょうか？

もうすぐ検査ですがとても不安です。

HIV PEP療法を続けている方で同じ症状を訴える方がいます。

そのため、薬の副作用というのも考えられます。しっかり服用できているのであれば、HIVはあまり考えられないかと思います。