オーラルセックスとゴムありの挿入をした2日後に38度の発熱と喉の痛みが酷く水も飲み込むのも痛いです。セックスの前から最近咳は多く出ていたのですが、これは咽頭の性病の可能性が高いのでしょうか？それとも、セックスのあと2日間は潜伏期間が短いため、普通の風邪でしょうか？

潜伏期間が微妙なところです。性行為があった場所にもよると思います。ラブホテルなどであれば換気が悪いので、症状が悪化する人が多いというのもあったりします。咽頭の淋病は症状もそこまで出やすいものではありません。